永磁變頻空壓機和變頻空壓機主要有以下區別：
永磁變頻空壓機采用的是高效稀土永磁電機，稀土永磁電機里面有一圈永久磁鐵圈，磁鐵圈在通電時釋放磁場，產生洛倫茲力，工作效率高，同時也比變頻要節能省電。而變頻空壓機則是普通的三相異步電機無論是工作效率或是節能效果都沒有永磁電機的好。永磁變頻空壓機的電機會根據用戶端氣量的變化，自動調頻改變電機功率從而很好地匹配電機輸出功率，無論是在輕載或過載的情況下其工作效率依然保持在高水平，其次永磁電機與壓縮機主機采用的是內嵌式一體軸直連結構，沒有電機軸承，傳動效率高，機械損耗也比變頻空壓機聯軸傳動小一點，消除故障點及降低保養成本，使用壽命較長。
變頻空壓機是通過變頻器的方式調節電機轉速，從而調節排氣量，使得產氣量與用氣量相適應，其次變頻空壓機所采用的電機都是額定轉速、額定功率和額定功率，變頻器強行迫使空壓機電機偏離額定轉速。因此變頻一旦偏離額定轉速，效率將大幅下降，偏離越多效率降幅越大。
變頻空壓正常的調節范圍大，也就是說當偏離工況時，變頻器將無法調節電機轉速，而永磁變頻空壓機的調節范圍大，也就是說永磁變頻空壓機在偏離工況時還能正常工作。
綜上，從工作效率來看，永磁變頻空壓機都要比變頻的好。
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